采收下来的鲜菇去除残留的泥土和培养料的污物，剔除有病虫的部分，装入牢固、无不良气味的容器中，如木箱、竹筐、塑料筐等，运往大中城市、小城镇或农村集市直接鲜销供应。鲜菇可短期贮藏，一般在2—5℃的范围内保持2—3天，时间延长，品质下降。
干制 由于球盖菇菇体含水量高不适于用晒干方法。宜采用人工机械脱水的方法。具体可参照蘑菇片脱水法、干草菇的脱水法等。或者把鲜菇经杀青后，排放于竹筛上，送入脱水机内进行脱水干燥。足干的球盖菇，其含水量在 11～13％之间。采用杀青后脱水干燥的球盖菇，香味较浓，食用时口感好，尤其是开伞菇用此法加工，质量有所改善。
盐渍 球盖菇可采用盐渍的方法进行加工，以调节淡旺季供求，满足市场的需要。具体工艺流程可参照盐水蘑菇的加工工艺进行。球盖菇菇体较大，杀青时间需8～12分钟，视菇体大小而定。煮至菇体熟而不烂，即可捞出冷却。一般熟的菇置冷水中会沉下，而生菇上浮。盐渍时可按一层盐一层菇装缸。盐水一定要没过菇体，上压重物，再加盖。缸内盐水达波美22度。
制罐：制罐操作工艺可参照蘑菇的加工方法进行。由于球盖菇菇体大小差异较大，挑选其中优质、大小适中的菇为原料较适宜。
