播种后30天左右，菌丝已基本长透培养料，这时可在堆表进行覆土。有时表面培养料偏干，看不见菌丝爬上草堆表面上来，可以轻轻挖开料面，检查中、下层料中的菌丝，若相邻的两个接种穴菌丝已快接近，这时就可以覆土了。具体的覆土时间还应结合不同季节，不同气候条件区别对待。多雨季节可待菌丝长透料后再覆土。若是干燥季节，可适当提前覆土，或者分二次来覆土，第一次可在建堆时少量覆土，仅覆盖在堆的上面，尚可见到部分的稻草；第二次覆土待菌丝已长透料时再进行。
把预先准备好的壤土铺在菌床上，厚度约2—4厘米，一般不超过5厘米，每平方米菌床约需0.05立方米的土壤。覆土完后必须调湿覆土层，要求土壤持水率达36～37%。简便的测定方法是用手捏土粒，土粒会变扁但不会碎，也不粘手，这样的覆土层含水量为适宜。
覆土后较干的菌床可喷水，但要求喷水的雾点以细为宜，达到水能湿润覆土层而不进入料内。正常的情况，覆土后2—3天，能见到菌丝爬上覆土层。覆土后主要的工作是调节好覆土层的湿度。为防止内湿外干，最好采用喷湿上层的覆盖物。覆土后，注意菌床内部含水量不宜过高，否则会造成菌丝衰退。因此，喷水量要根据场地的干湿程度、天气的情况灵活掌握。只要菌床内含水量适宜，有时也可间隔1一2天均不喷水，甚至是更长时间。
