所有食用菌都属于异养生物。按营养类型划分可分为腐生型、寄生型、共生型等。食用菌中以腐生型的为主，数量大，分布广。在腐生型食用菌中我们又可以进一步分为木生菌、草生菌、粪生菌、土生菌等。目前所知，已经进行人工大规模生产的食用菌绝大多数属于腐生菌。
木生菌利用木材的纤维素、木质素为碳素营养。如香菇、虎皮香菇、桃红侧耳、黄白侧耳、粉褶侧耳、血耳、平菇、榆黄蘑、茶薪菇等适合在阔叶树木材生长。如豹皮香菇、贝形侧耳等适合在针叶树木上生长。如盖囊侧耳、勺状侧耳、革耳、紫革耳、银耳、黑木耳、毛木耳、白木耳、砂耳、金针菇、堆金钱菇、密环菌、猪苓、牛排菌、墨汁鬼伞、毛头鬼伞、滑菇、猴头菌、平菇、银丝草菇、灵芝等适合在圬木上生长。而阿魏侧耳只适合在阿魏植物上生长。
草生菌利用草料中的养分而生活。如草菇、野蘑菇、双孢蘑菇、白秆蘑菇、紫蘑菇、平菇、风尾菇等。
粪生菌有草菇、蘑菇、高大环柄菇、鬼伞等。
土生菌利用土壤中有机质为养分而生活，如口蘑、马勃、羊肚菌、紫丁香蘑、长裙竹荪、短裙竹荪等。
有些食用菌可以随生活环境而改变营养方式，如密环菌可以寄生也可以腐生。如黑孢块菌可以与植物根部共生也可以腐生。
