采摘鲍鱼菇时，如温度高于25℃，袋子之间应相隔2-3厘米，让其通风降温；若温度偏低，可将带子靠紧排密，以增加保温性能。适当降低栽培场所的光线，增加通气量，保持空气温度在90%左右，每天喷水2-3次；在菇蕾出现前要逐步增加喷水量，但千万不能让菇盖积水，形成水斑。一般从菇蕾到采收约68天，当子实体长到菇蕾稍有内卷、孢子还未成熟时，即7-8成熟时及时采收。如果待孢子成熟后再采收，整个菇盖就会变色，松软且稍带苦味。采收时，一手压住袋口培养料，一手握住菌柄轻轻转动，将菇体摘下。
采收后清除袋口残留菇根，停止喷水1-2天，让菌丝恢复生长，而后又开始浇水保湿，促使第二潮菇体生长，经过10天后，第二批菇体开始生长。在适温范围内，出现周期为60-80天，生物效率为70-100%。鲍鱼菇可鲜菇出售、冷藏包装、外地销售或加工成罐头，其加工方法与蘑菇罐头加工方法相似。
